Действие игры происходит в 2023 году, в Нью-Йорке. Главным героем игры будет морпех под именем Алькатрас,но потом он облачится в нанокостюм второй версии и будет окончательно представлен именно в этом виде в игре. Значительному изменению подвергнется нанокостюм игрока. Режимы «сила» и «скорость», которые присутствовали в оригинале, будут объединены в новый — «мощь» (англ. Power). Второй режим — «проникновение» (англ. Infiltration) — станет пассивным и будет предоставлять расширенные по сравнению с оригиналом возможности стелса, включая опцию невидимости, которую нужно будет активировать дополнительно. Режим брони будет переработан.
