Действие Darksiders II разворачивается после Апокалипсиса и разрушения Третьего Королевства (Земли). Всадник Война находится в заключении и ожидает суда Обугленного Совета. Когда о подозрениях в предательстве Войны сообщают остальным Всадникам (Смерти, Ярости и Раздору), Смерть решает искупить грехи брата, стереть само преступление — то есть восстановить Третье Королевство. В поисках способа воскресить Человечество, Смерть отправляется в измерение за пределами трёх Королевств, носящее название Завеса, где обитает Хранитель Секретов, у которого Смерть надеется узнать ответы на свои вопросы. Тот соглашается, но с условием — Смерть заберёт у Хранителя амулет, в котором заключены души расы Нефилимов — братьев и сестёр Смерти. Но Смерть отказывается забрать амулет. После схватки с Хранителем Смерть всё же узнаёт, что ему нужно найти Древо Жизни, чтобы воскресить человечество. Однако во время схватки амулет разбивается, и его части врезаются в грудь Смерти.
